l.禅海蠢测 (1955)
2.楞严大义今释 (1960)
3.楞伽大义今释 (1965)
4.禅与道概论 (1968)
5.维摩精舍丛书 袁焕仙 南怀瑾合著 (1970)
6.禅话 (1973)
7.静坐修道与长生不老 (1973)
8.论语别裁 (1976)
9.习禅录影 (1976)
10.新旧的一代 (1977)
11.参禅日记(初集,原名:外婆禅) 金满慈著 南怀谨批(1980)
12.参祥日记(续集) 金满慈著 南怀谨批 (1983)
13.定慧初修 袁焕仙 南怀瑾合著 (1983)
14.孟子旁通(一) (1984)
15.净名庵诗词拾零·佛门楹联廿一副·金粟轩诗话八讲 (1984)
16.观音菩萨与观音法门 (1985)
17.历史的经验(一) (1985)
18.道家、密宗与东方神秘学 (1985)
19.中国文化泛言(原名:序集) (1986)
20.历史的经验(二) (1986)
21.禅观正脉(上) (1986)
22.一个学佛者的基本信念——华严经普贤行愿品讲记 (1986)
23.老子他说(上) (1987)
24.中国佛教发展史略述 (1987)
25.中国道教发展史略述 (1987)
26.易经杂说——易经哲学之研究 (1987)
27.金粟轩纪年诗初集 (1987)
28.如何修证佛法 (1989)
29.易经系传别讲 (1991)
30.圆觉经略说 (1992)
31.金刚经说什么 (1992)
32.药师经的济世观 (1995)
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